2022年11月9日20：30，白衣产学研名师工作室于综合楼1401会议室开展了本学期第六次文献分享会。白衣工作室分子生物学小组及分子信息学小组部分成员参与本次会议。白衣工作室指导老师张高博、张晓雯、左成参与指导与点评。本次文献分享会由朱心悦和万佳豪两位同学作为主讲人为大家带来分享。
朱心悦同学分享的文献是来自《Biotechnology and Applied Biochemistry》杂志的《Prediction and analyses of HLA-II restricted Mycobacterium tuberculosis CD4+ Tcell epitopes in the Chinese population》。朱心悦介绍到卡介苗一直被用于预防结核病，但它不能预防成年人的结核病。北京结核分枝杆菌(M.tuberculosis)是中国最流行的菌株，但目前还没有针对北京菌株的疫苗。本篇文献主要利用Vaxijen、AllerTOP和ToxinPred、IFN-γ表位服务器、IEDB和I-TASSER分别预测结核杆菌北京株的抗原性、致敏性、毒性、IFN-γ水平、人群复盖率和三维结构,从Rv1813c、Rv2608、Rv3131和Rv3628蛋白中获得100个杂乱表位。最终从Rv2608和Rv3131蛋白中筛选出7个表位作为疫苗候选抗原。本研究为进一步完善结核病多表位疫苗的设计提供了依据。
第二位主讲人万佳豪同学分享的文献是来自《Nucleic Acids Research》杂志的《T5 exonuclease-dependent assembly offers a low-cost method for efficient cloning and site-directed mutagenesis》。文献提及DNA组装作为一种方便高效的DNA克隆手段在生物学领域得到广泛的应用，其中Gibson组装技术实验成本较高，不适合广泛推广。实验室使用的ln-fusion实验方法也并不便宜。因此，需要一种更可靠、简单、具有成本效益的方法。作者在吃透当前多种DNA组装试剂和原理的基础上，对组装方法的各种组分进行了测试优化，发现在常规克隆应用中，仅利用含有T5核酸外切酶和PEG8000的一种简单缓冲体系，在30℃反应40分钟的组装效率要明显高于Gibson。组装TEDA方法配置简单、效果稳定、极大降低的成本。有利于DNA组装技术的进一步推广。
通过两位同学的分享我们分别了解到几种新的有关抗原表位预测的新的服务器，明白结核分枝杆菌分离株可能根据其对不同人群或地理位置的适应性表现出不同的细菌毒力水平，并具有高度的遗传多样性。还认识到组装TEDA方法在DNA克隆中高效性性与稳定性，这也为分子生物学小组后续的科研项目提供了一体新思路。
