2022年9月21日20:30，白衣工作室部分成员，于综合楼1401会议室开展了本学期第二次文献阅读分享会。本次会议参与人员：张高博老师、分子生物学小组和生物信息学小组部分成员。本次文献阅读分享会由刘一洋、刘银芳和刘思路三位同学作为主讲人进行。
首先，刘一洋同学分享了一篇发表在《Front Immunol》杂志的《Revelation of Potent Epitopes Present in Unannotated ORF Antigens of SARS-CoV-2 for Epitope-Based Polyvalent Vaccine Design Using Immunoinformatics Approach》文献。刘一洋同学在开始简要概括了这篇文献的主要内容，随后介绍了使用免疫信息学的方法对SARS-CoV-2未注释的ORF（uORF）抗原中存在的有效表位进行预测。通过免疫信息学分析确定23个uORF蛋白中存在的线性B细胞，构象B细胞，CD4+T细胞和CD8+T细胞表位，并经过严格的标准筛选，9个线性B细胞，1个构象B细胞，17个CD4+T细胞和13个CD8+T细胞uORF表位被列入候选名单。在入围的uORF表位中基于突变分析，最终将8个线性B细胞，1个构象B细胞，10个CD4+T细胞和12个CD8+T细胞表位作为有效表位。最后指出类似的免疫信息学分析也扩展到26种规范ORF蛋白。考虑到N蛋白、M/M.ext蛋白和ORF9b蛋白的高表达水平，作者也提出了针对SARS-CoV-2的多价疫苗设计。文献讲解后，台下的万佳豪同学也对这篇文章提出了自己的看法，并针对文章中的免疫原性、抗原性以及IC50等相关名词进行补充解释。张高博老师肯定了这种针对不了解不熟悉的知识点主动搜索解答的好习惯，并鼓励同学们一定要有质疑精神，多思考，勤笔记，带着问题来听讲座。
随后，刘银芳同学分享了一篇来自《JVet MedSci》的《Differential diagnosis of Brucella abortus by real-time PCR based on asingle-nucleotide polymorphisms》文献。刘银芳同学向我们介绍的这篇文献主要以流产式布鲁氏菌为研究对象，通过对传统检测布鲁氏菌的16rRNA和Bass-RNA方法与实时荧光PCR技术进行对比，分析得到后者具有更高的灵敏度的结论。该文献通过fbaA基因上的特异性单核苷酸设计用于B.abortus的杂交探针，再通过扩增曲线和熔融峰分析得到real time-PCR具有更高的灵敏度的结论。文中指出该结论有助于解决对牲畜与野生动物及人类的生殖问题，同时在公共卫生方面也做出巨大贡献。对于这篇文献，刘银芳同学说她在从中学到了研究方法的严密性以及实时荧光PCR相比起传统检测布鲁氏菌方法更敏感，更具体，更快速的测量目标微生物。同时了解的SNP在微生物分子分型中的应用诊断领域的应用越来越多，保守区域的SNP是特异性检测和鉴别病因的非常强的标志物。刘银芳同学对文献中如何判断基于杂交探针的实时荧光定量PCR和BaSS-PCR的检测敏感性的问题向张高博老师提出疑问。张高博老师耐心的为刘银芳同学答疑解惑也建议大家在阅读文献时有不清楚的地方可以和小组同学相互讨论。
最后，刘思路同学分享了一篇来自《中国药学杂志》的《藏药十八味党参丸提取物对脂多糖诱导的RAW26.7细胞Akt/p38mapk信号通路及M1/M2极化影响的探究》文献。她首先介绍了文献大致内容，文献以藏药十八味党参丸提取物（TEP）为研究对象，通过荧光酶标定定量分析，Griess法，流式细胞术，RT-qPCR法等分析方法，得到了TEP能够抑制细胞内ROS水平，降低NO分泌和炎性基因的表达水平，抑制细胞的M1表型，促进M2表型，其机制可能与细胞内iNOS、Akt和p38MAPK信号通路蛋白表达被抑制有关的结论。文中指出该结论进一步证明了TEP的浸提液具有抑制炎性反应与抗氧化损伤的作用，提高抗炎因子分泌，为临床治疗用药提供了实验依据，有望为治疗皮肤炎症相关疾病提供新的策略。对于这篇文献刘思路同学从中学到了TEP抑制炎性反应和抗氧化损伤的部分机理，特别是对M1/M2表型的不同作用机制。张高博老师指出刘思路的PPT制作能力上的不足，建议大家不要大幅的原文引用，而应该善于归纳和总结，提炼作者的有效观点，使听众更为清晰的了解作者的意图。
这次的文献分享会，大家不仅了解到了利用生物信息学工具进行抗原表位的预测，有关检测布鲁氏菌的16rRNA、Bass-RNA方法与实时荧光PCR技术三种方法，也对藏药藏药十八味党参丸提取物（TEP）有了一定了解。在文献分享中不仅培养了大家的科研兴趣，还锻炼了同学的主动学习、归纳总结、汇报演讲能力。在这次文献阅读分享会中，我们拓宽了知识深度，学会面对问题应该先独立思考，带着质疑精神和严谨的态度去看待问题，只有这样才能不断得到进步提升自己的能力。
