4月19日晚八点半，我院白衣工作室分子生物学小组、生物信息学小组和白衣天使协会部分成员，于综合楼1401会议室开展了本学期第次文献阅读分享会。指导教师张高博、分子生物学小组全体成员、生物信息学小组全体成员和白衣天使协会部分成员参与会议。此次会议由赵茹和高邦婷两位同学作为主讲人进行文献分享。
首先，赵茹分享了一篇发表在《Eurosurveillance》杂志的《Estimating the false-negative test probability of SARSCoV-2 by RT-PCR》文献。她简要地概括了这篇文献的主要内容，主要是通过逆转录聚合酶链反应( RT-PCR)检测评估 SARS-CoV-2 的假阴性检测概率，目的是确定感染患者获得假阴性检测的概率是如何受到症状出现和检测日期之间的天数以及棉签类型的影响。目前还在假设测试对象仅接受一次测试的情况下，估计不同测试个体队列中的假阴性数量，并评估测试特异性对这些结果的影响。接着是对研究方法的介绍部分，大致是使用广义加性混合模型，分析接受多次RT-PCR检测并至少一次被确定为SARS-CoV-2阳性的患者的公开数。本文通过一张数据源的表格以评估RT- PCR检测的敏感性和估计一组被测个体的假阴性数量。使用二项分布广义加性混合模型分析数据，并在统计软件上对评估RT-PCR测定灵敏度进行分析症状出现天数的影响建模为一个连续的平滑函数（三次回归）。然后，将一群对RT-PCR检测呈阳性的概率遵循形状为γ分布的感染个体的数据与RT-PCR灵敏度的结果结合使用，并应用贝叶斯定理来恢复从症状发作到RT-PCR测试的时间分布。
然后，整合了以上数据，以计算总体平均假阴性测试概率。RT-PCR证明了感染者在症状发作后接受检测的时间越晚，他们检测呈阳性的可能性就越小。这对识别感染患者、追踪接触者以及出院可能仍然具有传染性的康复患者具有重要意义。最后，通过这篇文献，大家了解到在只接受一次测试的个体中，将会出现假阴性结果，增加假阳性测试概率可以降低检测阳性的人数，且在被检测者的明显患病率较低的情况下，这种下降更为严重，同时大家对于RT-PCR技术也有了一定的了解。
随后，高邦婷分享了一篇来自《BMC Genomics》的《基于蛋白质表面螺旋特征的构象表位匹配与预测》。构象表位(CE)由位于抗原蛋白表面结构上的相邻氨基酸残基组成，用于CE分析的有效和高效的预测工具对于免疫学相关应用的开发至关重要，例如疫苗设计和疾病诊断。而在这篇文献仲，作者提出一种由两个顺序模块组成的新方法:匹配和预测。匹配模块包括两种主要方法。第一种方法是完整的序列搜索(CSS)，应用BLAST将序列与所有已知的抗原序列对齐。识别具有高表位序列身份的片段，并在查询结构上注释预测的残基。第二种方法是螺旋向量搜索( SVS)，当对照综合表位数据库进行查询时，采用一种新颖的表面螺旋特征向量进行大规模表面斑块检测。最后，通过这篇文献，让大家了解到，如果查询序列与表位数据库不相似，则 SVS 表面特征比较优于 CSS 方法，CSS方法灵敏度较低，特异性相对较高而SVS 方法比较表面贴片并考虑前三个聚类可提供更好的搜索性能。
会议最后，张高博发表指导建议。他建议参加本次会议的白衣天使协会的成员可以多多地阅读自己感兴趣的方向的文献。他说，同学们空闲的时候可以建立工作室的公众号，在运营期间可以加上“一问一答”模式，即向大家征求想要了解或者感兴趣的话题，然后发一篇解答推文来达到科普知识的效果。此外，张高博还建议同学们在空闲时间来了解一下荧光显微镜的使用，荧光显微镜是免疫荧光细胞化学的基本工具，它利用一定波长的光激发标本发射荧光，通过物镜和目镜系统放大以观察标本的荧光图像。
本次会议学习了关于RT-PCR技术的相关知识，了解到SARS-CoV-2感染假阳、阳性的原因，认识了B细胞表位和CE预测技术，同时，白衣天使协会的新成员对文献分享会有了更深的了解，在科研道路上迈出了一大步。
