10月26日晚，白衣工作室分子生物学实验小组和生物信息小组于综合楼1119办公室开展了本学期第五次文献阅读分享会。白衣工作室分子生物实验小组全体成员、白衣工作室生物信息学小组全体成员出席本次会议由张晨阳和刘益文两位同学作为主讲人。
首先，张晨阳为我们讲述的是《Association Between Enterovirus Infection and Type 1 Diabetes Risk：A Meta-Analysis of 38 Case-Control Studies》（IF=5.5）这篇文献。张晨阳开头介绍了I型糖尿病的病理病因和肠道病毒的分类，并根据相关研究指出二者可能有一定的联系，即肠道病毒对I型糖尿病的致病机制。为确定肠道病毒感染与I型糖尿病的关系，张晨阳讲到通过PubMed、Embase、科学网、Cochrane四个数据库以有关检索词、时间、语言为限制来检索相关文献进行分析。用Newcastle-Ottawa质量评估量表对纳入研究的详细信息进行质量评估和异质性检验考虑是否采用固定效应模型后进行统计分析，且还要进行敏感性检验，以排除某些低质量的研究或非盲法研究探讨对总效应的影响。最终得出共有38项研究报告了肠道病毒感染与I型糖尿病之间的关联。然后通过Mate分析、汇集分析、子群分析以及敏感性分析后得到肠道病毒感染与I型糖尿病有关的结论。在张晨阳讲到敏感性分析时，各组员积极提问。在解决疑惑的同时也趁着这个机会鼓励新成员，不必害羞，要不懂就问，抱着打破砂锅问到底的态度去弄懂新知。
接着，刘益文给我们带来的是一篇名为《Sequence-based prediction of SARS-CoV-2 vaccine targets using a mass spectrometry-based bioinformatics predictor identifies immunogenic T cell epitopes》（IF=11.117）的文献。刘益文以SARS-CoV-2的迅速传播导致全球大流行情况为背景，提出SARS-CoV-2有效疫苗的研制和抗病毒治疗迫在眉睫。刘益文讲述文献是先通过ViPR数据库中之前对相关冠状病毒科的研究来测试结合预测因子器是否能够有效地预测病毒肽。在确定该预测因子器对已知相关冠状病毒科病毒肽预测确实有效后，利用预测因子器预测SARS-CoV-2的抗原表位。在规避可能会引起自身免疫的抗原表位后，对结果进行评分排序和验证。因为不是每一个强MHC结合肽的表位都可以引起T细胞应答，所以还要进一步检验T细胞预测中高亲和力MHC结合肽的有效性。为了使大部分人在接种疫苗和病毒治疗中受益，需要计算各地区的HLA-I和HLA-II等位基因的肽的人群覆盖率，并选择覆盖率高的肽段。除此之外，还要考虑病毒蛋白在受感染宿主细胞中的表达程度，即利用蛋白质组学数据推断病毒蛋白的相对丰度。最后，该预测因子器预测提供了广泛的CD4+和CD8+ T细胞表位集，这些表位覆盖了整个SARS-CoV-2基因组，并结合了广泛的HLA-I和HLA-II等位基因。结束的最后，组员提出可以做一个流程图方便思维的跟进和对全篇有个大概认识的建议。
本次会议让大家明白提出问题需明确，分析问题需全面，判断问题需有理。对于一个问题的提出、分析及解决需要缜密的逻辑。虽说会议没有老师在一旁指导，但同学们成长有着一定的帮助，比如提高了主动自觉的能力，锻炼了独立思考的能力，培养了自我组织会议的能力等。
作者：张高博、刘益文
