10月12日晚,白衣产学研名师工作室分子生物学实验小组和生物信息学小组于综合楼会议室开展了本学期第三次文献阅读分享会。本次会议参议人员有指导教师张高博、白衣工作室分子生物学实验小组全体成员、白衣工作室生物信息学小组全体成员。本次会议由高叶蔚然和董元航两位同学作为主讲人讲解文献。

高叶蔚然为我们讲述的文献是发表在《PHARMACOLOGICAL RESEARCH》(IF=7.658)杂志上的文献----《Chinese herbal medicine for coronavirus disease 2019:A systematic review and meta-analysis》。高同学首先介绍了中草药(CHM)在治疗几种急性流行性传染病中的作用,并因此极佳的治疗效果被纳入了《新冠病毒的诊断和治疗指南》。随后,高同学从方法、结果、讨论三个方面来为大家解析该文献的结构。方法中包括入选标准、文献检索、数据提取、质量评估、数据分析,该作者从2020年6月21日起,在7个电子数据库中进行了全面的文献搜索,以评估COVID-19的CHM的有效性和安全性。登记了18个随机对照试验(RCTs),涉及2275名患者。大多数中药材都源于古典中草药配方。他们的荟萃分析发现,与CHM组和常规西医组相比,CHM组在肺CT、临床治愈率等评分等多个临床参数方面都有改进。总的来说,这种系统回顾和荟萃分析表明,CHM可能有利于治疗COVID-19,改善临床症状、成像和实验室指标,缩短病程,减少重症病例的数量。然而,考虑到原始试验的缺点,在CONSORT声明和CONSORT之后进一步严格签署试验证明了结论。高叶蔚然同学论文阅读认真,讲述过程逻辑清晰、语言精准,值得大家学习。同时张高博也建议高叶蔚然和小组成员们严格按照该文献所描述的方法和过程,模仿该实验的方法,重现实验结果和结论。

董元航为我们讲述的文献是发表在《PLOS ONE》(IF=2.806)上的文献----《Nested PCR Biases in Interpreting Microbial Community Structure in 16S rRNA Gene Sequence Datasets》。他从背景、分析、结果、讨论四个方面为我们解读了该文献的科研成果。首先背景是PCR扩增的16S rRNA基因测序已成为人类健康和环境科学领域微生物群落调查的常用方法。然而,当DNA数量过低,无法通过标准PCR扩增时,这种方法就很困难。巢式PCR可以对DNA浓度比标准PCR低几倍的样品进行扩增。然而,嵌套PCR可能影响群落结构测量的潜在偏差很少受到关注。最后的结论是,当标准PCR不起作用时,可以使用巢式PCR。但是,巢式PCR检测到的稀有类群需要其他技术进行验证。张高博老师通过叙说在笔袋中找笔的例子为同学们解释到巢式PCR的第一对PCR引物扩增片段和普通PCR相似,先是扩大样本量。然后使用第二套引物(第二套引物位于第一轮PCR产物内部)对第一轮PCR扩增的产物进行第二轮PCR扩增。
通过这次会议,经过这学期三次文献阅读分享会,张高博指出大家需要认真对待文献汇报的每一个过程,每次PPT制作也是一次梳理和凝练的过程。张高博还希望大家永远要提前准备,认真准备,不打无准备之仗。
这次文献阅读分享会结束后老师也提出新的要求----下学期的文献用全英文式制作,并且从下次会议开始,大家都要积极提问题,增加交流和互动,提出问题的同时也是在帮助文献汇报人员思考如何解答科学问题。白衣工作室一直以来都在倡导,科学研究是一个不断探索,不断求知的过程,只有大胆假设,主动思考,积极反馈,小心求证才是正确的科学态度和科学精神。