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【白衣工作室】开展白衣工作室文献阅读分享会

作者:王婷婷 发布时间:2021-04-23浏览次数:

4月22日,华夏白衣工作室生物信息学小组和分子生物学实验小组于综合楼会议室开展第四次文献阅读分享会。参会人员有指导教师张高博,生物信息小组全体成员,分子生物学实验组全体成员。本次会议由高邦婷、王嘉甬两位同学讲解文献。

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高邦婷为大家讲述的文献是张高博今年发表在《Microbial Pathogenesis(IF=2.91)上的文献--《Amino acid substitutions in VP2, VP1, and 2C attenuate a Coxsackievirus A16 in mice》。她从实验的介绍、材料和方法、结果和讨论四个方面来为大家讲述。该实验通过空班纯化及传代获得了两株动物实验毒力差异较大的柯萨奇病毒毒株。为了证明是哪些核苷酸位点的差异导致了柯萨奇病毒的减毒效应,张高博利用反向遗传学技术构建了该病毒的感染性cDNA克隆,并拯救获得了多株具有不同核苷酸突变的毒株。通过对一日龄的小鼠的腹腔中不同浓度梯度的不同病毒,计算和比较各个病毒毒株半数致死剂量LD50的差异来确定了病毒的减毒位点。张高博为我们讲述了实操的严谨与不易,同时张高博也对PPT的制作提出了格式上的要求:如图文的占比、对图片要等比拉伸、重点的标注等等,已经如何让倾听者快速了解到所需听讲文献的主要内容。

王嘉甬为我们讲述的是一篇生物信息学领域的SCI文献--《Identification of genetic variants associated with dengue or West Nile virus disease:a systematic review and meta-analysis》。作者通过对四个主要数据库应用搜索,查找迄今已发现的与登革热或西尼罗病毒疾病有关的所有已知遗传关联,通过关键词等筛选,找到并分析了与这些病毒感染显著相关的遗传变异。搜索的文库包括Medline、PubMed、Embase和GlobalHealth,比较的策略包括meta-analysis等。

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通过这次文献阅读分享会,倾听者可以学到快速了解到这篇文献的主要内容,学到新的知识技能,分享者可以锻炼阅读能力和归纳总结能力等等。过程中遇到问题,张高博也会详细地为大家讲解,解决疑惑。讨论过程中也会冒出许多新的点子,思想碰撞在一起才会摩擦出新的火花,这才是分享文献的主要目的。

   最后,张高博推荐了生信小组需要课下阅读生物信息学的书籍,对于统计学和流行病学的知识也要针对性的学习,便于后期的科研工作,也提出了后期他所在的白衣工作室想从事的多个研究方向,多位同学表示出了较高的兴趣和科研热情。如刘益文同学表示对用生物信息学分析古籍中的中医药配方等较感兴趣,准备会后花时间对该方面进行资料的收集查找。张高博建议大家课下要多花时间多看文献,保持对知识的好奇心,培养科研兴趣的同时锻炼自身能力,相信大家都能成为“五会”人才,在白衣工作室中找到大学的奋斗方向,以梦为马,不负韶华。

张高博、赵茹