2023年6月7日20：30时，白衣产学研名师工作室于图书馆408会议室开展了本学期第九次文献分享会。白衣工作室分子生物学小组、分子信息学小组、中医药小组及微生物小组部分成员参与本次会议。本次文献分享会由刘银芳和李子星两位同学作为主讲人为大家带来分享。
首先刘银芳同学分享了《基于单核苷酸多态性的实时荧光定量PCR鉴别诊断流产布鲁氏菌》，首先通过单核苷酸多态性和布鲁氏菌的诊断方法即血清学测定和细菌培养，引出本研究中开发的新的实时荧光定量PCR测定法。接着详细讲解了此种测定方法所需材料和具体步骤，即使用杂交探针进行实时PCR，再通过扩增曲线和熔融峰分析可以做出准确的诊断，实验中使用的探针是由fbaA基因上的特异性单核苷酸多态性设计而成。根据实验得到现象及结果，在流产布鲁氏菌II染色体的fbaA基因上检测到特异性SNP，设计了一个大小为176 bp的引物集和一个具有特定SNP的hybprobe在16SrRNA PCR中，在流产布鲁氏菌的情况下，其1，2和4类型出现了三个特定的波段（180bp，500bp和800 bp），但出现了其他流产双歧杆菌和其他布鲁氏菌物种仅显示两个波段（180bp和800 bp），非布鲁氏菌仅显示800 bp波段产物作为内对照。因此，BaSS-PCR具有检测流产式布鲁氏菌的局限性。提出讨论，新型实时荧光定量PCR可以成为一种高效的诊断技术，对该领域的流产双歧杆菌感染动物具有高灵敏度，并且还可能适用于公共卫生领域。
最后李子星同学为我们分享的是发表在《Ther Adv Vaccines Immunother 》上的《Predicting epitopes for vaccine development using bioinformatics tools》。文献介绍了在疫苗设计过程中，进行计算机研究以预测可以触发T细胞和B细胞反应的表位，进而产生细胞和体液免疫反应。免疫信息学的快速发展的特点是创建了用于预测B细胞和T细胞识别的表位以及抗原反应的工具。这里，李子星同学为我们重点介绍了用于细胞表位预测的网站。NCBI（www.ncbi.nlm.nih.gov），该网站用于查询与蛋白质相关的各种数据。一些分析程序也可以从本网站运行，包括搜索和检索系统，为用户提供对序列、映射、分类和结构数据的集成访问。此外，该网站还提供序列相似性搜索工具，可用于识别基因和遗传特征。PDB（www.rcsb.org），提供对蛋白质相关数据的访问，包括蛋白质来源、晶体学数据、化学结构、肽序列和基于核磁共振（NMR）的蛋白质结构。以及网站UniProt（www.uniprot.org），提供有关蛋白质的几乎完整的信息。它们都为研究的进行提供了巨大便利。接着介绍了常用于B细胞表位预测的两个网站，ABCpred（http://crdd.osdd.net/raghava/abcpred/）和BCPREDS（http://crdd.osdd.net/raghava/bcepred/）。最后介绍了T细胞表位预测，其中提到与B细胞表位预测相比，T细胞表位预测通常更容易，更准确，在预测T细胞识别的表位时，考虑表位和MHC 键以及表位-MHC和TCR复合物键非常重要。
经过这次的文献分享会，同学们了解到了多种细菌辨别、分离方法，还收集了多个用于细胞表位预测的网站，本次分享，开拓了思维，为同学们日后的研究提供了新思路。
