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【白衣工作室】开展新学期第一次论文阅读分享会

作者:潘金泼 王平凡 张高   时间:2022-09-19   点击数:

9月14日,白衣产学研名师工作室于综合楼1401会议室展开了本学期第一次文献阅读分享会。指导老师张高博和工作室部分成员参加了本次会议。会议开始前,张高博老师先对潘金泼和刘益文同学进行表扬:祝贺潘金泼获产学研优秀学生干部、刘益文获产学研优秀先进个人。同时希望各位同学继续努力、脚踏实地,在大学时期都能有所收获。接着由王平凡和李子星两位同学进行今天的文献分享。

首先,王平凡同学分享的是发表在《Analytical and Bioanalytical Chemistry》杂志(IF:4 290)上的《Application of quantitative PCR for the detection of microorganisms in water》文献。在开头部分,王平凡同学简单概述水传播中的病原体的感染和症状。然后,讲述荧光定量PCR和使用荧光定量PCR时加入的荧光信号如Taqman探针、Sybr Green Ⅰ染料法和分子信标。最后,指出使用荧光定量PCR在检测水中微生物的优点和缺点,并以军团菌视频结束分享。张高博根据这篇文献对王平凡同学的PPT提出建议:PPT内容要连贯、对比要明确、结构要有层次化、讲究并列与包含关系,并对三个荧光信号进行讲解,让同学们对此有了更清晰的理解。最后,张高博指出,白衣工作室也可以开展类似于这样的实验和研究,并告诉我们看文献要有自己的思考,同时要与我们的日常生活联系起来。

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随后,李子星同学分享了一篇《Biomed Research International》杂志(IF:3.2457)上的《A Bioinformatics Approach for the Prediction of Immunogenic Properties and Structure of the SARS-COV-2 B.1.617.1 Variant Spike Protein》文献。主要是从背景、材料方法、结果和讨论四个部分进行分享。对于背景,由于SARS-CoV-2与 bat-SL-CoVZC45、bat-SL -CoVZXC21两者菌株具有87%序列的相似性,由此SARS-CoV-2得名。病毒上的刺突(S)蛋白与人细胞上的血管紧张素转换酶2 (ACE2) 受体相互作用,导致SARS-CoV-2在细胞内内化,此外,S蛋白的突变可增强与ACE2的结合。B.1.617.1谱系首先在印度发现,其特征在于S蛋白和其他蛋白质的突变。本文采用计算机方法破译了SARS-CoV-2 B.1.617.1变体S蛋白部分S蛋白的结构和功能。对于方法,从理化表征、免疫原则预测、序列比对和结构预测和验证四个部分理论进行讲解。结果部分以图文的形式列出,并以此体现计算机科技对基因分析的重要性。最后的讨论与全文互相对应,并提出自己的思考:QUX03874.1的功能仍然是个谜,值得我们深入研究其三维X射线结构分析和翻译后修饰。

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这次会议,我们了解到了如何使用荧光定量PCR检测水传播中的病原体、三种荧光信号分子的作用原理和用生物信息学方法预测SARS-CoV-2 B.1.617.1变异刺突蛋白的免疫原性和结构。在这里,我们积少成多,坚持不懈,互助互励,成就更好的自己。


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