2021年11月23日20：30，白衣工作室分子生物学实验小组和生物信息学小组于综合楼1119办公室开展了本学期第八次文献阅读分享会。本次会议参与人员：指导老师张高博、通识中心副主任王星玥、白衣工作室分子生物学实验小组全体成员和白衣工作室生物信息学小组全体成员。本次会议由周琳、刘益文和赵育锋三位同学作为主讲人讲解文献。

首先，第一位同学周琳为我们讲述的是发表在《JAMA Network Open》杂志（IF=8.483）上的《Association of Circulating Tumor DNA With Disease-Free Survival in Breast Cancer：A Systematic Review and Meta-analysis》文献。周同学就乳腺癌的相关背景跟我们介绍乳腺癌检测的发展，并指出液体活检的其中一种被称为循环肿瘤DNA（ctDNA）的成分在检测乳腺癌以及临床和癌症结果方面显示出的新作用，并借此来发现早期疾病的进展或确定癌症的复发。因此，周同学告诉我们本文章就是通过信息检索、纳入标准、排除标准、数据提取和统计分析这一系列步骤来确定ctDNA与早期、局部晚期和转移性乳腺癌中乳腺癌disease-free survival和progression-free survival的相关性来证明使用ctDNA作为临床生物标志物是有可能在乳腺癌治疗后识别出患者临床前疾病复发情况的。周同学表示在该文章中的统计分析的亚组分析是我们值得学习的方法。因为在此之前组员们分享的各类Meta分析中都是对全部研究对象进行统计分析，而该文章在遇到异质性较高不适宜进行全体研究的情况下用到了亚组分析，即对其中的部分研究对象进行分析来解决异质性较高的问题。讲解的最后，张老师和王老师指出周同学PPT上的个别问题，并给出了一些建议。

接着，刘益文同学为我们带来的是发表在《Virology Journal》杂志（IF=4.099）上的《Prediction and evolution of B cell epitopes of surface protein in SARS-CoV-2》文献。刘同学讲述由于SARS-CoV-2引起全球大流行，SARS-CoV-2有效疫苗的研制变得尤为重要，而本文章就是通过预测其抗原表位来帮助有效疫苗的研制。该文章研究的对象是SARS-CoV-2病毒包膜中的刺突蛋白、包膜蛋白和膜蛋白，以NCBI、GISAID、ExPASy、TMHMM2.0、DNAstar和Consurf Server等各种数据库和在线软件来分析这三种蛋白的物理化学性质、二级结构和三级结构，并综合各因素来预测它们的抗原表位的序列位置，再将这些序列分别命名为A、B、C、D、E、F、G表位，然后对这七个表位进行保守性分析，确定这七个表位在应用过程中的长期效应和稳定性，最终得到七个可靠的抗原表位：A，B，C，D，E，F和G。张老师指出对我们后续研究来说，我们可以把研究对象换成另一类病毒，对其进行同样的方法进行预测，以此来锻炼并提高我们软件使用能力，为以后能够熟练地运用这些数据库和在线软件而打下坚实的基础，方便日后的科学研究。

最后，第三位同学赵育锋向我们分享的是发表在《mBio》杂志（IF=7.867）上的《The TMPRSS2 Inhibitor Nafamostat Reduces SARS-CoV-2 Pulmonary Infection in Mouse Models of COVID-19》文献。同样是在SARS-CoV-2引起全球大流行的背景下的研究，该文章通过研究蛋白酶抑制剂作为COVID-19的抗病毒预防或治疗策略为该药物临床前数据提供支持。赵同学向我们讲述的是SARS-CoV-2侵染宿主细胞时进入细胞的主要模式是细胞表面的膜融合，其中细胞表面蛋白酶如TMPRSS2，执行S2＇切割，其在入侵过程中发挥了“助攻”作用。为了减弱这种“助攻”作用，通过小鼠模型来检验Camostat和Nafamostat这两种抑制剂对SARS-CoV-2感染的抑制效果，并由实验数据得到Camostat和Nafamostat均可有效抑制SARS-CoV-2的感染，且Nafamostat在减少SARS-CoV-2感染方面表现出比Camostat更大的效力。除此之外，本文还证明了Nafamostat通过鼻内注入比腹膜内注入更加有效，且在感染SARS-CoV-2之前注入能够更好地保护机体免受感染，减少了感染的风险。张高博老师告诉我们可以从该文章中得到一些收获，一是减少成本的消耗。即通过转基因或腺病毒转导等方式，构建对SARS-CoV-2敏感的小鼠动物模型，从而替代成本较高的雪貂和猴动物模型；二是科学的结论一定是多角度证明得到的。实验得到一个科学的结论一定是需要多方面地考虑，多角度地验证自己的想法，一定要确保数据的真实性和有效性。

此次会议我们学到了很多，不仅是新方法的习得，还有运用能力的日后锻炼，以及从严谨的文献中培养自己对问题的思考。我们在一次次的会议中不断成长，思维高度不断提升，期待某一天我们能在一点点的累积下收获丰盛的果实。会议的最后，张高博老师为本学期后面的会议作了说明。即总结自己在今年的所获所得、计划的完成程度以及对未来的规划，为后期的学习确立明确的目标。