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【白衣工作室】文献阅读分享,拓宽学识广度— 我院白衣工作室文献阅读分享会

作者:张高博 王嘉甬   时间:2022-03-11   点击数:

2022年3月8日20:30,华夏生物信息学小组、分子生物学实验小组于综合楼会议室开展了本学期第二次文献阅读分享会。本次会议参与人员:指导老师张高博、白衣工作室分子生物学实验小组全体成员、白衣工作室生物信息学小组全体成员。本次会议由赵茹、张晨阳和王嘉甬三位同学主讲文献。

赵茹同学今晚分享的是发表在《analytical chemistry》上的《Novel One-Step Single-Tube Nested Quantitative Real-Time PCRAssay for Highly Sensitive Detection of SARS-CoV2》。文献主要介绍了一个新型单管巢式实时荧光定量聚合酶链式反应技术,通过与现在实验室用逆转录酶实时荧光定量聚合酶链式反应检测新冠病毒的方法比较,显示出新型单管巢式实时荧光定量PCR方法在临床样本中对新型冠状病毒2型的检测具有灵敏度高、易于适用的优点。

之后,张晨阳同学分享的文献主要介绍了研发疫苗环节中表位设计的流程,向同学们展示了分析蛋白质理化性质、T细胞表位预测、B细胞表位预测的方法,让同学们对表位设计有了更清晰的认识。

最后,王嘉甬同学分享了一篇发表在《中国中医药信息杂志》里的一篇《桂枝茯苓丸“异病同治”甲状腺结节、乳腺结节及子宫肌瘤网络药理学机制研究》。王同学以四部分逐步分析了文献的整体脉络:首先是获得中药材成分和疾病的共有靶点;第二步是整理靶点和药材成分及疾病的信息,构建网络图,通过直观数据,获得核心靶点;然后是对靶点作 GO 及 KEGG 通路富集分析,图表相互论证,表现靶点对发病症状的影响和对药物成分作用的通路路径地预测,最后是通过3D模型,说明药材成分对靶点所发挥作用的结合模式。这类分析过程,可以以中药的视角为疾病诊疗提供新的思路和作证。

对于文献分享,张老师也给出多方面的建议。例如大家在做文献汇报的时候,可以省去实验操作部分的具体数据,抓住并重点讲解专业名词的解释,需要在自己理解的基础上再去分享给大家,才能发挥举办文献分享会的优势。

这次的会议,大家不仅了解到了巢氏PCR的作用特性和优势以及其广阔的应用前景,也从免疫学和中药学两个角度了解到分子对接的信息技术对分析对接问题的优势及作用。大家在阅读文献和学习专用的应用软件的过程中,大家的知识面和应用能力都在不断地提升。


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