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产学研名师工作室

【白衣工作室】行远自迩,笃行不怠

作者:陈雨轩 万佳豪   时间:2023-03-27   点击数:

2023年3月22日20:30,白衣产学研名师工作室于图书馆408会议室开展了本学期第一次文献分享会。白衣工作室分子生物学小组及分子信息学小组部分成员参与本次会议。本次文献分享会由汪雨萍同学作为主讲人为大家带来分享。

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首先由汪雨萍同学分享的是发表在《Brazilian Journal of Medical and Biological Research》杂志上的《Homology modeling and epitope prediction of Der f33》发表时间于2018年5月10日SCI基础版 医学4区SCI SCIIF 2.90。这是一篇关于α-微管蛋白家族的过敏原Der f33 B细胞和T细胞表位预测研究。在本篇文献中,研究人员利用了生物信息学工具构建了Der f33的二级和三级结构,采用ABCpred、BCPreds、BcePred和生物信息学预测B细胞表位。通过NetMHCII2.2和NetMHCIIpan3.1鉴定与MHC分子结合得多肽,预测T细胞的表位。汪雨萍同学详细地介绍实验中所用到的同源建模法、Der f33基本序列性质,以及一些分析实验数据需要用到的软件。该研究将同源建模和从同源序列中提取的数据进行比较,用模板建立Der f33的目标结构,通过许多软件的检测,表明了Der f33预测模型可靠,再通过Der f33的二级、三级结构及其基本序列性质来预测B细胞和T细胞的表位。本研究结果可以为进一步研究和最终设计表位的Der f33疫苗奠定理论基础。

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随后在提问环节同为免疫小组的李子星同学为大家解释文献中所提及的拉氏图,所谓的拉氏图表现的是氨基酸残基理论上可以出现的构象,主要的应用是对同源建模后模型质量的检测。在最后的总结部分由学生负责人黎楚同学介绍了工作室目前的发展情况,同时希望工作室的新成员们都可以在文献分享会后积极提问,为工作室营造良好的氛围。万佳豪同学给大家提出了关于白衣工作室新闻稿的撰写要求,并希望大家对待学习和科学研究都能够认真严谨,能够在白衣工作室里有所成长和收获。

通过汪雨萍同学的分享,大家不仅认识了一些关于预测细胞表位的软件,而且知道如何对Der f33的二级、三级结构进行预测,为生物信息学小组的接下来学习和工作带来了帮助。


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